Il territorio di Vernio, in antichità fu abitato da popolazioni etrusche e poi romane, fu proprio in questo periodo che trasse il nome dall'accampamento nel quale le milizie Galliche svernavano.Inizialmente il territorio di Vernio fu dominato contemporaneamente da due famiglie, dai Conti Cadolingi di Fucecchio e dai Conti Alberti di Prato, ai quali passò completamente l'amministrazione di tutto il territorio di Vernio.
Le vicende di Vernio sono simili a tanti altri paesi di questi luoghi.
Tra gli eventi più rilevanti ricordiamo che nel congresso di Vienna del 1815, si stabilì che Vernio facesse parte del Granducato di Toscana.
L'economia di questi luoghi è stata legata molto alla terra, infatti l'attività prevalente fu l'agricoltura.
In tal senso il paese non si sviluppò molto, durante l'ottocento infatti orbitò molto nella vicina Prato.
Oggi nel paese sono presenti stabilimenti tessili specializzati nel carbonizzo, nella filatura e nelle rifinizioni.0